有鑒於遠洋鮪漁業規模日益龐大，且深具國際性，為團結業者，於民國五十九年六月十五日成立「台灣區鮪魚類輸出業同業公會」，嗣因遠洋鮪漁業日益發達，本會名稱僅限於鮪魚類之輸出，無法包含整個鮪漁業漁船生產與銷售，為符合實際情況遂於民國六十六年十一月更名為「台灣區遠洋鮪漁船魚類輸出業同業公會」。